Ученые научились искать гены в ДНК быстрее и точнее
Уряд РФ готується до падіння експорту нафти до Індії на 30% та дефіциту бюджету Саміт на Алясці став "великою аферою" Путіна, - WSJ Моді відмовився зупинити імпорт російської нафти, - Bloomberg Індія зухвало відмовила Трампу, нагадавши про торгівлю США і РФ "Дедлайн" Трампа для Кремля може пройти тихо і без наслідків, - AP Збільшення видобутку ОПЕК+ та нові погрози Трампа тиснуть на ціни на нафту На лінії фронту в Україні зона ураження стає дедалі глибшою: в The Economist назвали причини У російському Брянську пролунали потужні вибухи в районі аеропорту Трампу імпічмент, Венсу – посаду: Маск продовжує підливати масла у вогонь Росія масовано атакувала Україну дронами і ракетами: є руйнування і постраждалі Нічний удар Росії по Україні: жителі деяких міст залишилися без світла Росія планує у 2026 році захопити дві області та відрізати Україну від Чорного моря, - ОП У США закликали видворити Маска з країни після сварки з Трампом, - The Hill Низка поїздів спізнюється через наслідки атаки на Київ Під час нічного удару росіян у Києві загинули рятувальники Порошенко залишив собі слона і причіп, а всі дохідні активи намагався переписати на дружину, - ЗМІ В Україні з'явиться військовий омбудсмен: Рада зробила перший крок Унікальна спецоперація: СБУ втретє вразила Кримський міст Британія готова судитися з Абрамовичем, щоб передати Україні гроші із продажу "Челсі" Ключовий союзник Трампа підтримав законопроект про пекельні санкції проти РФ Росіяни зберігають можливості для масованих авіаударів, але тепер вони обмежені, - експерт Олена Тополя відверто зізналася, що робила пластику грудей Як рясні дощі вплинуть на врожай картоплі в Україні: відповідь фермера "Це не просто епізод": Шмигаль заявив, що "Павутина" може повторитись Генштаб відзвітував про знищення 12 російських літаків

Учёные из Германии, Америки и России предложили алгоритм для эффективного автоматического поиска генов, говорится в пресс-релизе МФТИ, разосланном 13 января.

"Разработка соединяет в себе преимущества наиболее продвинутых инструментов для работы с геномными данными", - отмечается в пресс-релизе.

Алгоритм BRAKER1, предложенный учеными, определяет, какие области в ДНК являются генами, а какие - нет. Для этого он определяет наиболее вероятное разбиение генома на кодирующие и некодирующие области.

Разработанную программу скачало уже более 1500 различных центров и лабораторий. Тестирование алгоритма показывает его существенно более высокую точность по сравнению с другими алгоритмами. Примерный хронометраж BRAKER1 на одном процессоре составляет приблизительно 17,5 часов для обучения и предсказания генов на геноме длиной 120 миллионов пар оснований. В дальнейшем время работы алгоритма может быть уменьшено за счёт использования параллельных процессоров. Определение генов - участков молекулы ДНК, по которым синтезируются РНК и белки - является одной из главных задач биоинформатики. Дело в том, что для многих исследований нужна информация не обо всей ДНК (длина которой составляет 2 метра для одной человеческой клетки), а только об этих информативных фрагментах ДНК. В будущем с помощью этих данных медики смогут диагностировать в том числе болезни сердца, диабет и рак.

Статья учёных опубликована в журнале Bioinformatics.